Jeśli nie zdecydujemy się na odliczenie całości podatku naliczonego związanego z samochodami, wówczas nieodliczoną część podatku możemy zakwalifikować do kosztów uzyskania przychodu. Warunkiem dokonania takiej kwalifikacji tego wydatku jest to, aby samochody służyły do prowadzenia działalności gospodarczej.
Okazuje się jednak, że zdaniem fiskusa nawet teoretyczna możliwość użycia samochodów do innych celów - prywatnych - może spowodować, że nieodliczony VAT nie będzie kosztem podatkowym. Fiskus może dokonywać ustaleń w tej kwestii np. na podstawie zapisów w firmowym regulaminie użytkowania samochodów służbowych. Jeśli regulamin dopuszcza użytek prywatny, może to posłużyć jako argument do zakwestionwoania VAT jako kosztu podatkowego.
